T-SOLURESEPTORIGEENIT, DNA -TUTKIMUS

Johdanto

T-solureseptorin uudelleenjärjestyminen on T-solun kypsymiseen liittyvä prosessi, jonka avulla T-solut pystyvät tunnistamaan lukemattomia erilaisia antigeenejä ja käynnistämään näin immuunivasteen. Kukin yksittäinen T-solu järjestää T-solureseptorigeeninsä uniikkiin tapaan, ja tavallisesti uudelleenjärjestymien jakauma on polyklonaalinen. Sen sijaan klonaalisissa T-soluisissa lymfoproliferatiivisissa taudeissa valtaosa T-soluista voi olla samaa kloonia, ja tällöin klonaalinen T-solureseptorigeenien klonaaliset uudelleenjärjestäytymät eivät ole täysin spesifisiä T-soluisille lymfoproliferatiivisille taudeille, vaan niitä voidaan tavata joskus myös B-soluisissa lymfoproliferatiivisissa taudeissa (ns. ristilinjaisuus). Myös ei-pahanlaatuisissa tiloissa voidaan joskus todeta klonaalisia uudelleenjärjestymiä, joten löydös tulee aina suhteuttaa muiden tutkimusten löydöksiin.

T-solureseptorigeenien klonaalisen uudelleenjärjestymän selvittämistä käytetään malignien lymfoproliferatiivisten sairauksien tutkimuksessa ja erotusdiagnostiikassa. T-solureseptorit (TCR) ovat kaksiosaisia molekyylejä, jotka koostuvat joko yhdestä delta- ja yhdestä gamma-ketjusta tai yhdestä alfa- ja yhdestä beta-ketjusta. T-solujen kypsymisen aikana ketjuja koodaavien geenien hypervariaabelialueilla (antigeeneihin sitoutuvat ns. CDR3-alueet) tapahtuu V-, D- ja J-segmenttien uudelleenjärjestymiä. Geenilokukset uudelleenjärjestyvät tietyssä järjestyksessä: ensin uudelleenjärjestyy TCR-delta, seuraavana TCR-gamma, sitten TCR-beta ja viimeisenä TCR-alfa.

Klonalitettitutkimuksella osoitetaan multiplex-PCR- ja fragmenttianalyysimenetelmällä mahdolliset pahanlaatuiseen lymfoproliferatiiviseen tautiin liittyvät T-solureseptorigeenien B:n (TRB) ja/tai G:n (TRG) klonaaliset uudelleenjärjestymät. Tulosta voidaan käyttää lymfoproliferatiivisten tautien diagnostiikassa. Näytteen tulee olla tuumorisoluosuudeltaan edustava (vähintään 10 %).

Tiedustelut

Fimlabin asiakaspalvelu puh. 020 785 1000

Indikaatiot

Lymfoproliferatiivisten sairauksien diagnostiikka, luokittelu ja seuranta.

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Atk-pyyntö. Mikäli atk-pyyntöä ei ole mahdollista tehdä, täytetään huolellisesti genetiikan lähete, joka löytyy ohjekirjan Lähetteet-kansiosta.

Huom! Kaikissa genetiikan tutkimuspyynnöissä tulee olla lähettävän lääkärin nimi ja yhteystiedot.

Näyte

0.5 - 1 ml luuydintä EDTA-putkessa, 6 ml verta EDTA-putkessa tai 0.5 x 0.5 cm palanen tuumoria genetiikan kudosnäytepurkkiin.

Tutkimus voidaan tehdä myös patologian parafiiniblokkinäytteistä. Genetiikan laboratorioon voidaan toimittaa joko parafiiniblokki tai siitä leikatut rullat (20 um leikkeitä). TCR-geenien klonaliteettihakuun tarvitaan n. 3 parafiinileikerullaa. HUOM! Mikäli näytteestä halutaan useampi geneettinen tutkimus, esim. Ts-TCR-D ja Ts-IG-D, tarvitaan rullia yhteensä 13 kpl. Ota tarvittaessa yhteys genetiikan laboratorioon (genetiikka@fimlab.fi) riittävän näytemäärän varmistamiseksi.

Tutkimuksen tilaaminen aiemmin otetusta näytteestä: jos tutkimuksen tilaustapa ei ole tuttu, ota yhteys genetiikan laboratorioon (genetiikka@fimlab.fi)

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

Näyte toimitetaan huoneenlämpöisenä mahdollisimman pian genetiikan laboratorioon. Tuorenäytteiden säilytys jääkaapissa.

Menetelmä

PCR ja fragmenttianalyysi kaupallisella IdentiClone TCRB Gene Clonality Assay- ja TCRG Gene Rearrangement Assay 2.0 -kiteillä.

Tulos valmiina

Tulos on valmiina 3-4 viikon kuluessa.

Tulkinta

Tutkimuksesta annetaan lausunto.