FLUORESENSSI IN SITU HYBRIDISAATIO -TUTKIMUS (FISH-TUTKIMUS)

Johdanto

Fluoresenssi in situ hybridisaatio (FISH) -tutkimuksella analysoidaan geneettisiä poikkeavuuksia synnynnäisten kehityshäiriöiden diagnostiikassa, sikiödiagnostiikassa sekä hematologisten maligniteettien ja muiden syöpien diagnostiikassa ja seurannassa. FISH:n avulla voidaan tunnistaa kokonaisia kromosomeja, kromosomin osia tai yksittäisiä geenejä käyttämällä tutkimustilanteeseen sopivia DNA-koettimia.

Tiedustelut

Fimlabin asiakaspalvelu puh. 020 785 1000

Indikaatiot

1) Synnynnäisten kehityshäiriöiden diagnostiikassa ja sikiödiagnostiikassa: 
- mikrodeleetio-oireyhtymät. Kts. Kromosomien mikrodeleetioiden FISH-tutkimus (4770 B-FISHDel)
- kromosomien G-raitatutkimuksessa löytyneen poikkeavuuden jatkoselvittelyt
- sikiödiagnostiikassa 13, 18 ja 21 -trisomioiden sekä sukukromosomien lukumääräpoikkeavuuksien tunnistaminen pikatutkimuksena (5238 Ts-FISH)
- kromosomitutkimus epäonnistunut tai ei ole mahdollista (mm. raskauden keskeytysnäytteet, kuolleena syntyneet)

2) Hematologisissa maligniteeteissa:
- spesifisen klonaalisen kromosomipoikkeavuuden tunnistaminen, ennusteellisesti merkittävät muutokset (Bm-FISH, Bm-FISHhem, B -FISHhem) 
- taudin seuranta ja hoitovasteen arviointi (Bm-FISHhem, B -FISHhem)

-myeloomapotilaan CD138-positiivisten solujen rikastus edesauttaa tautisolujen kiinnisaamista (9737 Bm-FISHMM)

3) Kiinteän kudoksen syöpien tutkimuksessa:
- spesifisen klonaalisen kromosomipoikkeavuuden tunnistaminen, levinneisyystutkimukset, taudin seuranta 

Lähete/tutkimuksen tilaaminen

Atk-pyyntö näytemuodosta riippuen: 5235, 4770, 6208 (veri), 5236 tai 6209 (luuydin), 5238 (lapsivesi, istukka, keskeytysnäyte, virtsa), 5239 (esim. tuumori tai muu kudos), 9737 (myeloomapotilaan luuydin). Mikäli atk-pyyntöä ei ole mahdollista tehdä, täytetään huolellisesti genetiikan lähete, joka löytyy ohjekirjan Lähetteet-kansiosta.

Lähetteeseen merkitään huolellisesti kliiniset tiedot ja kysymyksenasettelu, koska sen perusteella valitaan tutkimukseen soveltuva koetin ja menetelmä.

Huom! Kaikissa genetiikan tutkimuspyynnöissä tulee olla lähettävän lääkärin nimi ja yhteystiedot.

Näyte

Lapsivesi (ent. 5234 Am-FISH, 9759 Am-FISHDel): Pyydetään pyynnöllä Ts-FISH 5238. Tehdään jatkotutkimuksena 2150 Am-Kromos -tutkimukseen otetusta näytteestä.

B -FISH ja B-FISHDel: Tehdään jatkotutkimuksena 2151 B-Kromos -tutkimukseen otetusta näytteestä, tarvittaessa otetaan 4 ml verta Li-hepariiniputkeen. EI GEELIPUTKEEN.

B -FISHhem: 4 ml verta Li-hepariiniputkeen. EI GEELIPUTKEEN

Bm-FISH ja BM-FISHhem: Tehdään joko 2152 Bm-Kromos -tutkimukseen otetusta näytteestä tai otetaan tarvittaessa 1 ml luuydinnäytettä steriiliin näyteampulliin tai -putkeen, jossa ravintonestettä 8 ml ja 0,2 ml hepariinia.

Bm-FISHMM: 3 ml luuydintä steriiliin näyteampulliin tai -putkeen, jossa ravintonestettä 8 ml ja 0,2 ml hepariinia.

Istukka (ent. 5237 Cv-FISH, 9767 Cv-FISHDel): Pyydetään pyynnöllä Ts-FISH 5238. Tehdään jatkotutkimuksena 3641 Cv-Kromos -tutkimukseen otetusta näytteestä, tarvittaessa 10-40 mg preparoituja istukan nukkalisäkkeitä (korionvilluksia).

Ts-FISH: Kudosnäyte halkaisijaltaan väh. n. 0,5 cm palanen steriiliin purkkiin (geneettinen kudosnäyte) tai koeputkeen, jossa ravintonestettä (F10 tai MEM) tai fysiologista keittosuolaliuosta.

Tu-FISH: Tuumorinäytteen parafiiniblokki kokonaisena tai blokista viisi edustavaa 20 µm parafiinileikettä eppendorf-putkessa.

Näytteen säilytys, kuljetus ja esikäsittely

B -FISH, B-FISHDel, B -FISHhem, Bm-FISH, BM-FISHhem, Bm-FISHMM ja Ts-FISH: Näyte toimitetaan laboratorioon huoneenlämpöisenä mahdollisimman pian, viimeistään seuraavana päivänä näytteenotosta. Näyte ei saa kylmettyä kuljetuksen aikana.

Lapsivesi ja istukka: Näyte toimitetaan huoneenlämpöisenä mahdollisimman pian genetiikan laboratorioon. Näytteen on oltava genetiikan laboratoriossa näytteenottopäivän aikana (keskeytyneissä raskauksissa viimeistään seuraavana päivänä), eikä se saa kylmettyä kuljetuksen aikana.

Tu-FISH: Parafiiniblokki säilyy huoneenlämmössä vuosia. Valmiiksi leikatut leikkeet tulisi kuitenkin toimittaa genetiikan laboratorioon mahdollisimman pian, viimeistään seuraavana päivänä näytteenotosta. 

Menetelmä

Fluoresoivalla värillä leimatulla DNA-koettimella hybridisoidaan tutkittavasta näytteestä tehty sytogeneettinen preparaatti. Analysointi fluoresenssimikroskoopilla käyttäen tietokonepohjaista kuva-analyysiä.

Tulos valmiina

Tulos valmiina 1 - 2 viikon kuluessa. Pikadiagnostiikkana 1 - 2 työpäivässä näytteen saapumisesta lukien.

Tulkinta

Tutkimuksesta annetaan kirjallinen lausunto, jossa selvitetään tuloksen kliinistä merkitystä annettujen lähetetietojen perusteella. Tuloksen ollessa poikkeava sikiötutkimuksessa tai synnynnäisten kehityshäiriöiden tutkimuksessa suositellaan perinnöllisyysneuvontaa tai perinnöllisyyslääkärin kannanottoa. Syöpänäytteiden FISH-tutkimusten osalta konsultoidaan tarvittaessa hematologian ja patologian erikoisaloja.